2. Search ten nucleotide sequences of HIV-1 subtype-B and ten nucleotide sequences of HIV-1 subtype-E from the public domain such as Genbank, DDBJ or EMBL by using the key words in 1.

HIV 1 Subtype B

>BU84798:

AAAGCCATGTGTAAAATTAACCCCACTCTGTGTTACTTTAAATTGCAGTGATTATAGGAATGCTACTGAT

TATAAGAATGCTACTGATACCACTAGTAGAAACGAGGGAAAGATGGAGAGAGGAGAAATAAAAAACTGCT

CTTTCATTATCACCACAAGCATAAAAAATAAGATGCAGAAAGAATATGCACTTTTCTATAAACTTGATAT

AGTACCAATAGATAATACAAGCTATACATTGATAAGTGGTAACAACTCAGTCATTACACAGGCCTGTCCA

AAGGTATCCTTTGAACCAATTCCCATACATTATTGTGTCGGTGGTTTTGCGATTCTAAAGTGTAATGATA

AGAAGTTCAATGGAAAAGGAGCATGTAAAAATGTCAGGACAGTACAATGTACACATGGAATTAGGCCAGT

AGTATCAACTCAACTGCTGTTAAATGGCAGTCTAGCAGAAGAAGAGGTGGTAATTAGATCTGACAATTTC

ACAGACAATACTAAAACCATAATAGTACAGCTGAAAGAATCTGTAGAAATTAATTGTATAAGACCCAACA

ATAATACAAGAAAAGGTATACATATTGGACCAGGGAGAGCATGGTATGCAACAGGAGAAATAGTAGGAGA

TATAAGACAGGCATATTGTAACATTAGTAGAACAAAATGGAATAACACTTTAATACAGATAGCTAACAAA

TTAAAAGAACAATATAATACAACAATAAGCTTTAATCGATCCTCAGGAGGGGACCCAGAAATTGTAACGC

ATAGTCTTAATTGTGGAGGGGAATTTTTCTACTGTAATTCAACACAACTGTTTAATAGTACTTGGAATTT

AAATGGTACTTGGAATTTTACTGCAGGGTCAAATGAAACTGAAGGCAATATCACACTCCCATGCAGAATA

AAACAAATTATAAACAGGTGGCAGGAAGTAGGAAAAGCAATGTATGCCCCTCCCATCAGTGGACAAATTA

GATGCTCATCAAACATTACAGGGATGATATTAACAAGGGATGGTGGTAACGAGAACAATAATGAGAGCAG

TACTACTGAGACCTTCAGACCGGGAGGAGGAGATATGAGGAACAATTGGAGAAGTGAATTATATAAATAT

AAAGTAGTAAAAATTGAACCATTAGGAGTAGCACCCACCAAGGCAAAGAGAAGAGTGGTGCAGAGAGAAA

AAAGAGCAGTGGGAGCGCTAGGAGCTATGTTCCTTGGGTTCT

>BU84797:

AAAGCCATGTGTAAAATTAACCCCACTCTGTGTTACTTTAAATTGCAGTGATTATAGGAATGCTACTGAT

TATAAGAATGCTACTGATACCACTAGTAGTAACGAGGGAAAGATGGAGAGAGGAGAAATAAAAAACTGCT

CTTTCAATATCACCACAAGCATAAAAAATAAGATGCAGAAAGAATATGCACTTTTCTATAAACTTGATAT

AGTACCAATAGATAATACAAGCTATACATTGATAAGTGGTAACACCTCAGTCATTACACAGGCCTGTCCA

AAGGTATCCTTTGAACCAATTCCCATACATTATTGTGTCCGTGGTTTTGCGATTCTAAAGTGTAATGATA

AGAAGTTCAGTGGAAAAGGAGAATGTAAAAATGTCAGCACAGTACAATGTACACATGGAATTAGGCCAGT

AGTATCAACTCAACTGCTGTTAAATGGCAGTCTAGCAGAAGAAGAGGTGGTAATTAGATCTGACAATTTC

ACAGACAATACTAAAACCATAATAGTACAGCTGAAAGAATCTGTAGAAATTAATTGTATAAGACCCAACA

ATAATACAAGAAAAGGTATACATATAGGACCAGGGAGAGCATGGTATGCAACAGGAGAAATAGTAGGAGA

TATAAGACAGGCATATTGTAACATTAGTAGAACAAAATGGAATAACACTTTAATACAGATAGCTAACAAA

TTAAAAGAACAATATAATACAACAATAAGCTTTAATCGATCCTCAGGAGGGGACCCAGAAATTGTAACGC

ATAGTTTTAATTGTGGAGGGGAATTTTTCTACTGTAATTCAACACAACTGTTTAATAGTACTTGGAATTT

AAATGGTACTTGGAATTTTACTGCAGGGTCAAATGAAACTGAAGGCAATATCACACTCCCATGCAGAATA

AAACAAATTATAAACAGGTGGCAGGAAGTAGGAAAAGCAATGTATGCCCCTCCCATCAGTGGACGAATAA

GATGCTCATCAAACATTACAGGGATGATATTAACAAGGGATGGTGGTAACGAGAACAATAATGAGAGCAC

TAATACTGAGATCTTCAGACCGGGAGGAGGAGATACGAGGGACAATTGGAGAAGTGAATTATATAAATAT

AAAGTAGTAAAAATTGAGCCATTAGGAGTAGCACCCACCAAGGCAAAGAGAAGAGTGGTGCAGAGAGAAA

AAAGAGCAGTGGG

>BU84796:

AAAGCCATGTGTAAAATTAACCCCACTCTGTGTTACTTTAAATTGCAGTGATTATAGGAATGCTACTGAT

TATAGGAATGCTACTGATACCACTAGTAGTAACGAGGGAAAGATGGAGAGAGGAGAAATAAAAAACTGCT

CTTTCAATATCACCACAAGCATAAAAAATAAGATGCAGAAAGAATATACACTTTTCTATAAACTTGATAT

AGTACCAATAGATAATACAAGCTATACATTGATAAGTGGTAACACCTCAGTCATTACACAGGCCTGTCCA

AAGGTATCCTTTGAACCAATTCCCATACATTATTGTGTCCGTGGTTTTGCGATCCTAAAGTGTAATGATA

AGAAGTTCAATGGAAAAGGAGAATGTAAAAATGTCAGCACAGTACAATGTACACATGGAATTAGGCCAGT

AGTATCAACTCAACTGCTGTTAAATGGCAGTCTAGCAGAAGAAGAGGTGGTAATTAGATCTGACAATTTC

ACAGACAATACTAAAACCATAATAGTACAGCTGAAAGAATCTGTAGAAATTAATTGTATAAGACCCAACA

ATAATACAAGAAAAGGTATACATATAGGACCAGGGAGAGCATGGTATGCAACAGGAGAAATAGTAGGAGA

TATAAGACAGGCATATTGTAACATTAGTAGAACAAAATGGAATAACACTTTAATACAGATAGCTAACAAA

TTAAAAGAACAATATAATACAACAATAAGCTTTAATCGATCCTCAGGAGGGGACCCAGAAATTGTGACGC

ATAGTTTTAATTGTGGAGGGGAATTTTTCTACTGTAATTCTACACAACTGTTTAATAGTACTTGGAATTT

AAATGGTACTTGGAATTTTACTGCGGGGTCAAATGAAACTGAAGGCAATATCACACTCCCATGCAGAATA

AAACAAATTATAAACAGGTGGCAGGAAGTAGGAAAAGCAATGTATGCCCCTCCCATCAGTGGACAAATAA

GATGCTCATCAAACATTACAGGGATGATATTAACAAGGGATGGTGGTAACGAGAACAATAATGAGAGCAG

TACTACTGAGACCTTCAGACCGGGAGGAGGAGATATGAGGGACAATTGGAGAAGTGAATTATATAAATAT

AAAGTAGTAAAAATTGAGCCATTAGGAGTAGCACCCACCAAGGCAAAGAGAAGAGTGGTGCAGAGAGAAA

AAAGAGCAGTGGGAGCGCTAGGAGCTATGTTCCTTGGGTTCT

>BU84793:

AAAACCATGTGTAAAATTAACCCCACTCTGTATTACTTTAAATTGCACCAATTGGAAGAAGAATGATACT

AAAACTAGTAGTAGTAGTACTACAACTAATAGTAGTTGGGGAGAGATAAAGGAGGGAGAAATAAAGAACT

GCTCTTTCAATATCACCACAAGCATAAGAGACAAGGTGAAGAAAGAATATGCACTTTTTTATAGCCTTGA

TGTAGTACCAATAGAAAATGATAATACTAGCTATAGGTTGAGAAGTTGTAACACCTCAGTCATTACACAA

GCCTGTCCAAAGGTAACTTTTGAGCCAATTCCCATACATTATTGTACCCCGGCTGGTTTTGCGATCCTGA

AGTGTAAAGATAAAAAGTTCAATGGAACAGGACCATGCAAAAACGTTAGCACAGTACAATGTACACATGG

AATTAAGCCAGTAGTGTCAACTCAACTGCTGTTAAATGGCAGCCTAGCAGAAGAAGAGGTAATAATTAGA

TCTGCCAATTTCTCAAACAATGCTAAAATCATAATAGTACAGTTGAGGGAACCTGTAGAAATTAATTGTA

CAAGACCCAGCAACAATACAATAAAAGGTATACACATAGGACCAGGGAGAGCATTTTATGCAACAGGAGA

CATACGAGGAGATATAAGACAAGCACATTGTAACATTAGTGGAGCAAAATGGAATAACACTTTAAAGAAG

GTAGTTATAAAATTAAAAGAACAATTTCCAAATAAAACAATAGTCTTTAACCATTCCTCAGGAGGGGACC

CAGAAATTGTAATGCACAGTTTTAATTGTCAAGGGGAATTTTTCTACTGTAATACAACAAAGCTGCTTAA

TAGTACTTGGAATGATACTACAGAGTCAAATAACAATGATAGTACTATTACACTCCCATGCAGAATAAAA

CAAATTATAAACATGTGGCAGGAAGTAGGAAAAGCAATGTATGCCCCTCCCATCAGAGGAGAAATTAAAT

GTTCATCAAATATTACAGGACTACTGTTAACAAGAGATGGTGGTATTAACACTAGCGATGCCACCGAGAC

CTTCAGACCGGGAGGAGGAGATATGAGGGACAATTGGAGAAGTGAATTATATAAATATAAAGTAGTGAAA

ATTGAGCCATTAGGAGTAGCACCCACCAAGGCCAAGAGAAGAGTGGTGCAGAGAGAAAAAAGAGCAGTAA

CACTAGGAGCTATGTTCCTT

>BU84792:

AAAACCATGTGTAAAATTAACCCCACTCTGTATTACTTTAAATTGCACCAATTGGAAGAAGAATGATACT

ACAACTAATAATAGTAGTGCTACAGCTAATAGTAGTAGTACTACAACTAATAGTAGTTGGGGAGAGATAA

AGGAGGGAGAAATAAAGAACTGCTCTTTCAATATCACCACAAGCATAAGAGACAAGGTGAAGAAAGAATA

TGCACTTTTTTATAGCCTTGATGTAGTACCAATAGAAAATGATAATACTAGCTATAGGTTGAGAAGTTGT

AACACCTCAGTCATTACACAAGCCTGTCCAAAGGTAACTTTTGAGCCAATTCCCATACATTATTGTACCC

CGGCTGGTTTTGCGCTTCTGAAGTGTAAAGATAAAAAGTTCAATGGAACAGGACCATGCAAAAATGTTAG

CACAGTACAATGTACACATGGAATTAAGCCAGTAGTGTCAACTCAACTGCTGTTAAATGGCAGCCTAGCA

GAAGAAGAGGTAATAATTAGATCTGCCAATTCCTCAAACAATGCTAAAATCATAATAGTACAGTTGAGGG

AACCTGTAGAAATTAATTGTACAAGACCCAGCAACAATACAATAAAAGGTATACACATAGGACCAGGGAG

AGCATTTTATGCAACAGGAGACATACGAGGAGATATAAGACAAGCACATTGTAACATTAGTGGAGCAAAA

TGGAATGACACTTTAAAGAAGGTAGTTATAAAATTAAAAGAACAATTTCCAAATAAAACAATAGTCTTTA

ACCATTCCTCAGGAGGGGACCCAGAAATTGTAATGCACAGTTTTAATTGCCAAGGGGAATTTTTCTACTG

TAATACAACAAAGCTGTTTAATAGTACTTGGAATAGCACTTGGAATAATACTACAGAGTCAAATAACAAT

GATAGTACTATTACACTCCCATGCAGAATAAAACAAATTATAAACATGTGGCAGGAAGTAGGAAAAGCAA

TGTATGCCCCTCCCATCAGAGGAGAAATTAAATGTTCATCAAATATTACAGGACTACTGTTAACAAGAGA

TGGTGGTATTAACACTAGCGATGCCACCGAGACCTTCAGACCGGGAGGAGGAGATATGAGGGACAATTGG

AGAAGTGAATTATATAAATATAAAGTAGTGAAAATTGAGCCATTAGGAGTAGCACCCACCAAGGCTAAGA

GGAGAGTGGTGCAGAGAGAAAAGAGAGCAGTTACACTAGGAGCTATGTTCCTT

>BU84801:

AAAGCCTAAAGCCATGTGTAAAGTTAAACTCACTCTGTGTTACTTTAAAGTGCAAGGATAAATGACAAAC

TGCTCTTTCAACATCACCACAAGTATAAGAGATAAGGTGCAGAAAGAATATGCACTTTTGTATAAACTTG

ATGTAGTACCAATAGAAGAAGATGACAATACTAGCTATAGATTGATAAGTTGTAACACCTCAGTCATTAC

ACAGGCCTGTCCAAAGGCATCCTTTGAGCCAATTCCCATACATTATTGTGCCCCGGCTGGTTTTGCGATT

CTAAAGTGTAATGATAAGAAGTTCAATGGAACAGGACCATGTAAAAACGCCAGTACAGTACAATGTACAC

ATGGAATTAGGCCAGTAGTATCAACTCAACTGTTGTTAAATGGCAGTCTAGCAGAAGAAGAGGTAGTAAT

CAGATCTGCCAATTTCACAGACAATGCTAAAACCATAATAGTACATCTAAATGAAACTGTAAAAATTAAT

TGTACAAGACTTGGCAACAATACAAGAAAAAGTATAAATATAGGACCAGGGAGAGTACTCTATGCAACAG

GAGAAATAATAGGAGACATAAGACAAGCACATTGTAACATTAGTAGAGCAAAATGGAATAACACTTTAAA

ACAGATAGTTAGAAAATTAAGAGAACAATTTGGGAATAAAACAATAGTCTTTAATCAATCCTCAGGAGGG

GACCCAGAAATTGTAATGCACAGTTTTAATTGTGGAGGGGAATTTTTCTACTGTAATTCAACACAACTGT

TTAATAGTACTTGGAATAATACTTGGAAGGATCCTAACAGGAGCGACAATATCACACTCCCATGCAGAAT

AAAACAAATTATAAACATGTGGCAGGAAGTAGGAAAAGCAATGTACGCCCCTCCCATCAGAGGGGAAATT

AGATGTTCATCAAATATCACAGGGCTGCTACTAACAAGAGATGGTGGTAATGACGATGGTAATGACACGA

CCACAAACAGGACCGAGATCTTCAGACCTGGAGGAGGAGATATGAGGGACAATTGGAGAAGTGAATTATA

TAGATATAAAGTAGTAAAAATTGAACCATTAGGAATAGCACCCACCAGGGCAAAGAGAAGAGTGGTGCAG

AGAGAAAAAAGAGCAGTAGGACTAGGAGCTTTGTTCCTTGGGTTCTTGGGAGCAGCAGG

>BU84802:

AAAGCCTAAAGCCATGTGTAAAGTTAACCTCACTCTGTGTTACTTTAAAGTGCAAGGATAAATGACAAAC

TGCTCTTTCAACATCACCACAAGTATAAGAGATAAGGTGCAGAAAGAATATGCACTTTTGTATAAACTTG

ATGTAGTACCAATAGAAGAAGATGACAATACTAGCTATAGATTGATAAGTTGTAACACCTCAGTCATTAC

ACAGGCCTGTCCAAAGACATCCTTTGAGCCAATTCCCATACATTATTGTGCCCCGGCTGGTTTTGCGATT

CTAAAGTGTAATGATAAGAAGTTCAATGGAACAGGACCATGTAAAAATGTCAGCACAGTACAATGTACAC

ATGGAATTAGGCCAGTAGTATCAACTCAACTGTTGTTAAATGGCAGTCTAGCAGAAGAAGAGGTAGTAAT

CAGATCTGCCAATTTCACAGACAATGCTAAAACCATAATAGTACATCTAAATGAAACTGTAAAAATTAAT

TGTACAAGACTTGGCAACAATACAAGAAAAAGTATAAATATAGGACCAGGGAGAGTACTCTATGCAACAG

GAGAAATAATAGGAGACATAAGACAAGCACATTGTAACATTAGTAGAGCAAAATCGAATAACACTTTAAA

ACAGATAGTTAGAAAATTAAGAGAACAATTTGGGAATAAAACAATAGTCTTTAATCAATCCTCAGGAGGG

GACCCAGAAATTGTAATGCACAGTTTTAATTGTGGAGGGGAATTTTTCTACTGTAATACAACACAACTGT

TTAATAGTACTTGGAATAATACTTGGAAGGATCCTAACAGGAGTGACAATATCACACTCCCATGCAGAAT

AAAACAAATTATAAACATGTGGCAGGAAGTAGGAAAAGCAATGTACGCCCCTCCCATCAGAGGGGAAATT

AGATGTTCATCAAATATCACAGGGCTGCTACTAACAAGAGATGGTGGTAATGACGATGGTAATGACACGA

CCACAAACAGGACCGAGATCTTCAGACCTGGAGGAGGAGATATGAGGGACAATTGGAGAAGTGAATTATA

TAGATATAAAGTAGTAATAATTGAACCATTAGGAATAGCACCCACCAGGGCAAAGAGAAGAGTGGTGCAG

AGAGAAAAAAGAGCAGTAGGACTAGGAGCTTTGTTCCTTGGGTTCTTGGGAGCAGCAGG

>BU84807:

AAAGCCATGTGTAAAATTAACCCCACTCTGTGTTACTTTAAATTGCACTGATGATTTAGGGAATGCTACT

AATACCAATAGTAGTGCCACTACTAATAGTAGTAGTTGGGAAGAAATGAAGGGGGAAATGAAAAGATGCT

CTTTCAATATCACCACAAGCATAAGAGATAAGATTAAGAAAGAACATGCACTTTTCTATAGACTTGATGT

AGTACCAATAGATAATGATAATACCACATATAGGTTGATAAATTGTAATACCTCAGTCATTACACAGGCC

TGTCCAAAGGTATCATTAGAGCCAATTCCCATACATTTTTGTGCCCCGGCTGGTTTTGCGATTCTAAAGT

GTAATAATAAGACGTTCGAGGGAAAAGGACCATGTAAAAATGTCAGCACAGTACAATGTACACATGGAAT

TAGGCCAGTAGTGTCAACTCAACTGCTGTTAAATGGCAGTCTAGCAGAAGAAGAGGTAATAATTAGATCT

GACAATATCACAGACAATACTAAAACCATTATAGTACAGCTAAACGAATCTGTAGTAATTAATTGTACAA

GACCCAACAACAATACAAGAAAAAGTATACATATAGGACCAGGGAGTGCATTTTTTGCAACAGGAGAAAT

AATAGGAGATATAAGACAAGCACACTGTAACCTTAGTAGAACACAATGGAATAACACTTTAGGAAAGATA

GTCATAAAATTAAGAGAACAATTTAGAAAACAATTTGGAGAAAAAACAATAGTCTTTAATCGATCCTCAG

GAGGGGACCCGGAAATTGCAATGCACAGTTTTAATTGTGGAGGGGAATTTTTCTACTGTAACACAACAGC

ACTGTTTAATAGTACCTGGAATGTTACTAAAAGGTTGAATAACACTGAAGGAAATAGCACAGGAGATGAA

AATATCATACTCCCATGTAGAATAAAACAAATTATAAACATGTGGCAGGAAGTAGGAAAAGCAATGTATG

CCCCTCCCATCAGTGGACAAATTAGATGTTCATCGAATATTACAGGGCTGCTACTAACAAGAGATGGTGG

TAGTAAGAACGAGAGCATCACCACCGAGGTCTTCAGACCTGGAGGAGGAGATATGAGGGACAATTGGAGA

AGTGAATTATATAAATATAAAGTAGTAAAAATTGAACCATTAGGAGTAGCGCCCACCAAGGCAAAGAGAA

GAGTGGTGCAGAGAGAAAAAAGAGCAGTGGGAACAATAGGAGCTATGTTCCTTGGGTTCTTGGG

>BU84810:

AAAGCCATGTGTAAAATTAACCCCACTCTGTGTTACTTTAAATTGCACTGATGATTTAGGGAATGCTACT

AATACCAATAGTAGTGCCACTACCAATAGTAGTAGTTGGGAAGAAATGAAGGGGGAAATGAAAAGATGCT

CTTTCAATATCACCACAAGCATAAGAGATAAGATTAAGAAAGAACATGCACTTTTCTATAGACTTGAGGT

AGTACCAATAGATAATGATAATACCACATATAGGTTGATGAATTGTAATACCTCAGTCATTACACAGGCC

TGTCCAAAGGTATCATTTGAGCCAATTCCCATACATTTTTGTGCCCCGGCTGGTTTTGCGATTCTAAAGT

GTAATAATAAGACGTTCGAGGGAAAAGGACCATGTAAAAATGTCAGTACAGCCCAATGCACACATGGAAT

TAAGCCAGTAGTGTCAACTCAACTGCTGTTAAATGGCAGTCTAGCAGAAGAAGAGGCAATAATTAGATCT

GACAATATCACAGACAATACTAAAACCATTATAGTACAGCTAAACGAATCTGTAGTAATTAATTGTACAA

GACCCAACAACAATACAAGAAAAAGTATACATATAGGCCCGGGGAGTGCATTTTTTGCAACAGGAGAAAT

AATAGGAGATATGAGACAAGCACACTGTAACCTTAGTAGAACACAATGGAATAACACTTTAGGAAAGATA

GTCATAAAATTAAGAGAACAATTTAGAAAACAATTTGGAGAAAAAACAATAGTCTTTAATCGATCCTCAG

GAGGGGACCCGGAAATTGCAATGCACAGTTTTAATTGTGGAGGGGAATTTTTCTACTGTAACACAACAGC

ACTGTTTAATAGTACCTGGAATGTTACTAAAGGGTTGAATAACACTGAAGGAAATAGCACAGGAGATGAA

AATATCATACTCCCATGTAGAATAAAACAAATTATAAACATGTGGCAGGAAGTAGGAAAAGCAATGTATG

CCCCTCCCATCAGTGGACAAATTAGATGTTCATCAAATATTACAGGGCTGCTACTAACAAGAGATGGTGG

TAGTAAGAACGAGAGCATCACCACCGAGGTCTTCAGACCTGGAGGAGGTGATATGAGGGACAATTGGAGA

AGTGAATTATATAAATATAAAGTAGTAAAAATTGAACCATTAGGAGTAGCGCCCACCAAGCCAAAGAGAA

GAGTGGTG

>BU84813:

AAAGCCATGTGTAAAATTAACCCCACTCTGTGTTACGTTAAATTGCACTGACCCAAATGTTACTAATAGC

GAGAGAACAATAGAGGGGGGAGAAATAAAAAATCGCTCTTTCAATATCACCACAAACATAAGAGATAGGT

TTCAGAAAGAATATGCACTTTTTTATAAACTTGATGTAATACCATTAGGTAATGATAATACTAGCTATAG

GTTGATAAGTTGTAACACCTCAGTCATTACACAGGCCTGTCCAAAGGTATCCTTTGAGCCAATTCCCATA

CATTATTGTGCCCCGGTTGGTTTGGCGATTCTAAAGTGTAAAGATAAGAAGTTCAATGGAACAGGACCAT

GTACAAATGTCAGCACAGTACAATGTACACATGGAATTAAGCCAGTAGTATCAACTCAACTGTTGTTATA

TGGCAGTCTAGCAGAAGAAGACATAGTAATTAGATCCGCCAATCTCACAGACAATGCTAAAAACATAATA

GTACAGCTGAATGAATCTGTAACAATGAATTGTACAAGACCCAACAACAATACAATGAAAAGTATACATA

TAGGACCAGGCAGAGCAATTTATGCAACAGGAAACATAATAGGAGATATAAGACAAGCACATTGTAACAT

TAGTGGGACAAAATGGAATGACACTTTGAACAAGATAGCTATAAAATTAAGAGAACAATTTAATGAGGCA

ATAGTCTTTAATCAATCCTCAGGAGGGGACCCAGAAATTGCAACGCTCAGTTTTAATTGTGGAGGGGAAT

TTTTCTACTGTAATTCAACACAACTGTTTAATAGTACTTGGAATAGTACTGGGTCAAATAACACTAAAGG

AAAGGACACAATCACACTCCCATGCAGAATAAGACAAATTATAAACATGTGGCAGAAAATAGGAAAAGCA

ATGTATGCCCCTCCCATCAAAGGGCAAATTAGATGTTCATCAAATATTACAGGGCTAATATTAATAAGAG

ATGGTGGTAACAACAACATGAGCAAGACCACCGAGACCTTCAGACCTGGAGGAGGAGATATGAGGGACAA

TTGGAGAAGTGAATTATATAAATATAAAGTAGTAAAAATTGAACCATTAGGAGTAGCACCCACCAGGCCA

AAGAGAAGAGTGGT
 
 
 
 
 
 

HIV 1 Subtype E

>Eu48275:

GCCAGTGGTATCAACTCAATTGCTGTTAAATGGCAGTCTAGCAGAAGAAGAGATAATAATCAGATCTGAA

AATCTCACAAACAATGCCAAAACCATAATAGTGCACCTTAATAAATCTGTAGAAATCAATTGTACCAGAC

CCTCCAACAATACAAGAACAAGTATAACTATGGGACCAGGACAAGTATTCTATAGAACAGGAGACATAAT

AGGAGATATAAGAAAAGCATATTGTGAGATTAATGGAACAAAATGGAATGAAGCTTTAAAACAGGTAACT

GGAAAACTAAAAGAGCACTTTAATAAGACAATAATCTTTCAACCACCCTCAGGAGGAGATCTAGAAATTA

CAATGCATCATTTTACTTGTAGAGGGGAATTTTTCTATTGCAATACAACACAACTGTTTAATAATACTTG

CATAGGAAATGAAACCATGGAGGGGTGTAATGGCACTATCATACTTCCATGCAAGATAAAGCAAATTATA

AACATGTGGCAGGGAGCAGGACAAGCAATGTATGCTCCTCCCATCAGTGGAAGAATTAATTGTGTATCAA

ATATTACAGGAATACTATTGACAAGAGATGGTGGTGCTAATAATACGGCTAACGAGACCTTCAGACCTGG

AGGAGGAAA

>Eu48278:

GCCAGTGGTATCAACTCAATTGCTGTTAAATGGCAGTCTAGCAGAAGAAGAGATAATAATCAGATCTGAG

AATCTCACAAACAATGCCAAAACCATAATAGTGCATCTTAATAAATCTGTAGAAATCAATTGTACCAGAC

CCTCCAACAATACAAGAACAAGTATAACTATGGGACCAGGACAAGTATTCTATAGAACAGGAGACATAAT

AGGAGATATAAGAAAAGCATATTGTGAGATTAATGGAACAAAATGGAATGAAGCTTTAAAACAGGTAACT

GGAAAACTAAAAGAGCACTTTAATAAGACAATAATCTTTCAGCCACCCTCAGGAGGAGATCTAGAAATTA

CAATGCATCATTTTAGTTGTAGAGGGGAATTTTTCTATTGCAATACAACACAACTGTTTAATAGTACTTG

CATAAGAAATGAAAGCATGGAGGGGTGTAATGGCACTATCATACTTCCATGCAAGATAAAACAAATTATA

AACATGTGGCAAGGCGCAGGACAAGCAATGTATGCTCCTCCCATCAGTGGAAGAATTAATTGTGTATCAA

ATATTACAGGAATACTATTGACAAGAGATGGTGGTGCTAATAACACGGCTAACGAGACCTTCAGACCTGG

AGGAGGAAA

>Eu48277:

GCCAGTGGTATCAACTCAATTGCTGTTAAATGGCAGTCTAGCAGAAGAAGAGATAATAATCAGATCTGAA

AATCTCACAAACAATGCCAAAACCATAATAGTGCACCTTAATAAATCTGTAGAAATCAATTGTACCAGAC

CCTCCAACAATACAAGAACAAGTATAAATATAGGACCAGGACAAGTATTTTATAGAACAGGAGACATAAT

AGGAGATATAAGAAAAGCATATTGTGAGATTAATGAAACAAAATGGACTAAAGTTTTAAAACAGGTAACT

GAAAAATTAAAAGAGCACTTTAAGAATAAGACAATAATCTTTCAACCACCCTCAGGAGGAGATCTAGAAA

TTACAATGCATCACTTTAATTGTAAAGGGGAATTTTTCTATTGCAATACAACACAACTGTTTAATAATAC

TTGCATAAAAAATGAAACCATGGGGGGGTGTAATGGCACTATCATACTTCCATGCAAGATAAAGCAAATT

ATAAACATGTGGCAGGGAGCAGGACAAGCAATGTATGCTCCTCCCATCAGTGGAAGAATTAATTGTGTAT

CAAATATTACAGGAATACTATTGACAAGAGATGGTGGTGCTAATAATACGACTAACGAGACCTTCAGACC

TGGAGGAGGAAA

>Eu48274:

GCCAGTGGTATCAACTCAATTGCTGTTAAATGGCAGTCTAGSAGAAGAAGAGATAATAATCAGATCTGAA

AATCTCACAAACAATGCCAAAACCATAATAGTGCACCTTAATAAATCTGTAGAAATCAATTGTACCAGAC

CCTCCAACAATACAAGAACAAGTATAACTATAGGACCAGGACGAGTATTCTATAGAACAGGAGACATAAC

AGGAGATATAAGAAAAGCATATTGTGAGATTAATGGAACAAAATGGAATGAAGTTYTAAAACAGGTAACT

GAAAAATTAAAAGAGCACTTTAAGAATAAGACAATAATCTYTAAACCACCCTCAGGAGGAGATCTAGAAA

TTACAATGCATCATTTTAATTGTAGAGGGGAGTTTTTCTATTGCAATACAACAAATTTGTTTAATAATAC

TTGCATAAATGAAACCATGRGAGGGTGTAATGACACTATCACACTTCCATGCAAGATAAAGCAAATTATA

AACATGTGGCAGGGAGCAGGACAAGCAATGTATGCTCCTCCCATCAGTGGAAGAATTAATTGTGTATCAA

ATATTACAGGAATACTATTGACAAGAGATGGTGGTGCTCATAATGATACTAAGGAGATCTTCAGACCTGG

AGGAGGAAAAAGCC

>Eu48273:

GCCAGTGGTATCAACTCAATTGCTGTTAAATGGCAGTCTAGCAGAAGAAGAGATAATAATCAGATCTGAA

AATCTCACAGACAATACCAAAACCATAATAGTGCACCTTAATAAATCTGTAGAAATCAATTGTACCAGAC

CCTCCAACAATAAAAGAACAAGGATAACTATAGGACCAGGACGAGTATTCTATAGAACAGGAGAAATAAT

AGGAGATATAAGAAAAGCATATTGTGAAATTAATGGAACAAAATGGAATAAAGTTTTAAAACAGGTAACT

GAAAAATTAAAAGGGCACTTTAATAAGACAATAGTCTTTCAACCACCCTCAGGAGGAGATCTAGAAATTA

CAATGCATCATTTTAATTGTAGAGGGGAATTTTTCTATTGCAATACAACAAAACTGTTTAATAATACTTG

CATAAATGAAACCATGGGGGGGTGTAATGACACTATCACACTTCCATGCAAGATAAAGCAAATTGTAAAC

ATGTGGCAGGGAGCAGGACAAGCAATGTATGCTCCTCCCATCAGTGGAAGAATTAATTGTGTATCAAATA

TTACAGGAATACTATTGACAAGAGATGGTGGTGGTGATGCTAATAATAGGAAGAACGAGACCTTCAGACC

TGGAGGAGGAAA

>Eu48265:

GCCAGTGGTATCAACTCAATTGCTGTTAAATGGCAGTCTAGCAGAAGAAGAGATAATAATCAGATCTGAA

AATCTCACAAACAATGCCAAAACCATAATAGTGCACCTTAATAAATCTGTAGAAATCAATTGTACCAGAC

CCTCCGATATTACAAGAATAAGTACAAGAATAGGACCAGGACGAGTATTCTATAAAACAGGAAACATACT

AGGAGATATAAGAAAAGCATATTGTGAGATTAATGGAACAAAATGGAATGAAACTTTAAAACAGGTAGCT

GGAAAATTAAAAGAGCACTTTAATAAGACAATAATCTTTAAACCACCCTCAGGAGGAGATCTAGAAATTA

CAATGCATCATTTTAATTGTAGAGGGGAATTTTTCTATTGCAATACAACACAACTGTTTAATAGTACTTG

GCCAGGAAATGAAACCATGGAGAAGTATAATGGCACTATCACACTTCCATGCAAAATAAAGCAAATTATA

AACATGTGGCAGGGAGCAGGACAAGCAATGTATGCTCCTCCCATCAGTGGAACAATTAATTGTGTATCAA

ATATTACAGGAATACTATTGACAAGAGATGGTGGTCCTAATAGTACGAATAATGAGACCTTCAGACCTGG

AGGAGGAAA

>Eu48267:

GCCAGTGGTATCAACTCAACTGCTGTTAAATGGCAGTCTAGCAGAAGAAGAGATAATAATCAGATCTGAA

AATCTCACAAACAATGCCAAAACCATAATAGTGCACCTTAATAAATCTGTAGAAATCAATTGTACCAGAC

CCTTCTATACAAGAATAAGTATGACTAGGGGACCAGGACACGTATTCTATAGAACAGGAAAAATAGTAGG

AGATCCAAGAAAAGCATATTGTGAGATTAATGGAACAAAATGGAATGAAGCTTTAAAACAGGTAACTGAA

AAATTAAAAGAGCACTTTAATAAGACAATAATCTTTCAACCACCATCAGGAGGAGACCTAGAAATTACAA

TGCATCATTTTAATTGTAGAGGGGAATTTTTCTATTGCAATACAACAAAACTGTTTAATAGTACCGGGAT

AGGAAATGAAACCATGAAGGGGTATAATGACACTATCACACTTCCATGCAGGATAAAGCAAATTATAAAC

ATGTGGCAGGGAGCAGGACAAGCAATGTACGCTCCTCCAATCAAAGAAAGAATTAATTGTGTATCAAATA

TTACAGGAATACTATTGACAAGAGATGGTGGTATTAATAGTACGACTAACGAGACCTTCAGACCTGGAGG

AGGAAAAAGCC

>Eu48268:

GCCAGTGGTATCAACTCAACTGCTGTTAAATGGCAGTCTAGCAGAAGAAGAGATAATAATCAGATCTGAA

AATCTCACAAACAATGCCAAAACCATAATAGTGCACCTTAATAAATCTGTAGAAATCAATTGTACCAGAC

CCTCCAACAAGAAAAGACAAAGGGTAACTATAGGGCCAGGACGAGTATACTATAGCACAGGAGACATAAT

GGGAGATATAAGAAAAGCACATTGTGAAATTAATGGAACAAAATGGAATAAAGTTTTAAAACAGGTAACT

GAAAAATTAAAAGAGCACTTTAATAAGACAATAGTCTTTCAACCACCCTCAGGAGGAGATCTAGAAATTA

CAATGCATCATTTTAATTGTAGAGGGGAATTTTTCTATTGCAATACAACAAGTCTGTTTAATAATACTTG

CATAGGAAGTGAAACCCTGTGTAATGGCAAGATCACACTTCCATGCAAGATAAAGCAAATTATAAACATG

TGGCAGGGAGTAGGACAAGCTATGTATGCTCCTCCCATTACTGGAAAAATTAATTGTGTATCAAATATTA

CAGGAATACTATTGACAAGAGATGGTGGTAATAATACGAATAACGAGACCTTCAGACCTGGAGGAGGAAA

>Eu48269:

GCCAGTGGTATCAACTCAATTGCTGTTAAATGGCAGTCTTGCAGAAGAAGAGATAATAATCAGATCTGAA

AATCTCACAAACAATGCCAAAACCATAATAGTGCACCTTAATAAATCTGTGGAAATCAATTGTACCAGAC

CCTCCGACAGGATGAGAACACCTATGAGAATAGGACCAGGACGAGTATTCTATAAAACAGGAAACATAAT

GGGAGATAGAAGAACAGCATACTGTGAAATTAATGGAACAAAATGGAATAGAGTTTTAAAACAGGTAATG

GGAAAATTAAAAGAGCACTTTAATAATAAGACAATAACCTTTCAACCACCCTCAGGAAGAGATCTAGAAA

TCACAATGCATCATTTTAATTGTAGAGGGGAATTTTTCTATTGCAATACAACACGACTGTTTAATAATAC

TTGCATAGGAAATGAAACTAAGGAGGGGTGTAATGGCACTATCACACTTCCATGCAAGATAAAGCAAATT

ATAAAAATGTGGCAGGGAGTAGGACAAGCAATGTATGCTCCTCCCATCAGTGGAATAATTAATTGTTTAT

CAAATATTACAGGAATACTATTGACAAGAGATGGTGGTCCTAATAATATGACTAATGAGACCTTCAGACC

TGGAGGAGGAAA

>EU48272:

GAAGAAGAGATAATAATCAGATCTGAAAATCTCACAAACAATGCCAAAACCATAATAGTGCACCTTAATG

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TAGTGATACTAATGA
 
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